Reiki I. derece inisiyasyonu kişiyi evrensel yaşam gücü enerjisine açar. Ellerdeki çakralar açılır ve dokunarak enerjinin aktarılması sağlanır. Reiki I seviyesi, genellikle fiziksel düzeyde şifa uygulamaları içindir. Elle dokunarak şifanın öğrenildiği düzeydir. Bu seviyeye Shoden (başlangıç) aşaması denilmektedir.

Reiki II. derece inisiyasyonu şifa enerjisini artırır. Ruhsal bedenimizle ilgilidir. Kişiyi, duygusal, zihinsel ve karmik yönden tedavi eder. Fiziksel olarak yakınımızda bulunmayan birine uzaktan Reiki enerjisi gönderebilmeyi sağlar. 3 adet sembol ve bunların kullanımı öğretilir. Bu seviyeye Okuden (derin bilgi) aşaması denilir.

Reiki III : Uygulayıcı ve Master seviyesi olmak üzere iki kısımda öğretilir. Reiki III - İleri Reiki Eğitimi (Advanced Reiki Training - ART), öğrencinin master sembolüne inisiye olmasını, aura temizleme ve tedavi tekniğini, kristal taşlarla çalışmayı ve Reiki Rehberi meditasyonunu kapsar. Master olmaya hazırlığın bir parçası olduğu gibi master olmayıp sadece şifa yeteneklerini artırmak isteyenler için eğitim sürecine eklenmiştir. Bu seviye eğitim, çok güçlü ve etkili şifa tekniklerini içerir. Reiki III - Master seviyesi hocalık derecesidir. Bu en yüksek aşamaya Shinpiden (sırların öğretisi) denilir.